小木虫战略合作伙伴

生物帮战略合作伙伴

中山大学实习基地

中华医学会战略合作伙伴

020-38856244

020-85600812

首页 >> 服务项目
新闻资讯
服务热线:

020-38856244

020-85600812

研究人员提出一种用于鉴定微量样品m6A的高效便捷建库测序技术

时间:2021-09-11 作者: 点击:0次

  中山大学生命科学学院骆观正教授团队提出一种用于鉴定微量样品m6A的高效便捷建库测序技术,鉴定到数千个高重复性m6A位点,为促进m6A功能研究提供方法学创新。


  N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A) 是真核生物mRNA中含量最丰富的碱基修饰类型,动态调控mRNA的剪接、定位、降解等多种代谢通路,进而参与细胞分化、肿瘤发生、免疫反应等重要生理过程。甲基化RNA免疫共沉淀高通量测序(MeRIP-Seq 或m6A-Seq) 是目前应用最广泛的m6A检测技术,但该技术通常需要大量起始RNA样品(>100μg总RNA),难以应用于微量样品的m6A检测,限制了其在临床稀缺样品和早期胚胎发育等场景中开展m6A研究。因此,该领域急需一种适用于低起始RNA量、简单快捷的m6A高通量测序技术。

  该研究提出一种m6A高通量测序新技术:tMeRIP-Seq。该技术通过多聚胸腺嘧啶引物特异性地反转录含有PolyA尾的mRNA,利用Tn5转座酶切割RNA/DNA杂合链的特性,将mRNA/DNA杂合链片段化同时加上测序接头,极大地降低样品初始投入量并简化实验操作。基于这一策略,该研究以低至60ng总RNA为起始模板,鉴定到数千个可重复m6A位点,这些位点特异地富集于基因3′末端附近,并且有典型的RRACH基序。之后研究者应用该技术从一滴血中鉴定了m6A图谱,发现多个血液疾病相关基因可能受m6A调控。基于类似原理,tMeRIP-Seq技术未来还可能拓展到其它RNA修饰研究中。

声明:本网所有文章(包括图片和音视频资料)系出于传递更多信息之目的,且明确注明来源和作者,不希望被转载的媒体或个人可与我们联系(dajin@sciedit.cn),我们将立即进行删除处理。所有文章仅代表作者观点,不代表本站立场。

电话咨询

小程序

微信扫一扫

手机版

手机扫一扫

官方微信

微信扫一扫